Deuda de EPS en Colombia llega a COP$58 billones en 2025

Una crisis que se acelera: COP$58 billones y solo 4 EPS a flote

Las Entidades Promotoras de Salud (EPS) en Colombia cerraron 2025 con deudas acumuladas de COP$58 billones con hospitales, clínicas y empresas farmacéuticas, según un informe de la Contraloría General de la República conocido por El Tiempo y replicado por Bloomberg Línea. El saldo representa un alza del 26,5% frente al año anterior, es decir, más de COP$12 billones adicionales en solo doce meses.

El dato retrata un sistema que se deteriora más rápido de lo que las autoridades logran intervenir: de las 28 EPS que operaban al cierre del análisis, solo cuatro cumplieron la totalidad de los requisitos financieros que exige la ley. El resto, que en conjunto concentra a la inmensa mayoría de los afiliados del país, no pasa los filtros de capital, patrimonio o reservas.

El sistema en números: qué muestra el informe de la Contraloría

El documento de la Contraloría pinta un cuadro excepcionalmente concentrado en el incumplimiento:

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Deuda total: COP$58 billones con la red de prestadores y proveedores, +26,5% interanual.
EPS que cumplen todos los requisitos: 4 de 28: Aliansalud, Anas Wayúu, EPM y Salud Mía. Entre todas representan menos del 2% de los afiliados del sistema.
EPS con pérdidas: 17 de las 26 que entregaron información terminaron 2025 en rojo.
Gasto vs. ingreso: en promedio, las EPS destinaron a la atención de sus afiliados el equivalente al 110% de los recursos que recibieron por UPC (Unidad de Pago por Capitación).
Deuda con proveedores de medicamentos: pasó de COP$2,85 billones en 2024 a COP$3,8 billones en 2025, un incremento del 33%.

El organismo de control fue directo sobre las consecuencias: «Se incrementan las barreras de acceso para los pacientes, quienes enfrentan retrasos o dificultades para recibir los medicamentos prescritos, con efectos adversos sobre la continuidad de los tratamientos», advirtió.

Por qué los gastos superan los ingresos: la UPC en el centro del debate

El desequilibrio entre lo que el sistema reconoce por cada afiliado y lo que cuesta atenderlo es el motor estructural del descalabro. Cuando la Contraloría cruzó los números, encontró que 17 de las 26 EPS que reportaron datos gastaron más de lo que ingresaron, configurando un déficit operativo generalizado que la sola gestión interna no puede corregir.

Sobre ese punto, la Corte Constitucional ya se pronunció: declaró que el valor de la UPC fijado por el Ministerio de Salud era insuficiente y ordenó un reajuste técnico, según reportó Infobae. Ante el incumplimiento reiterado, en diciembre de 2025 se abrió un incidente de desacato contra el entonces ministro de Salud Guillermo Alfonso Jaramillo. El propio informe de la Contraloría recoge esta decisión como parte del contexto que explica el deterioro financiero.

Es decir, hay un componente regulatorio y otro operativo: el dinero que entra por usuario no alcanza para pagar la atención, y eso se traduce en facturas impagas a clínicas, hospitales y farmacéuticas.

Nueva EPS: el agujero negro del sistema

Nueva EPS es la aseguradora más grande del país, con cerca de 11,6 millones de afiliados, y se encuentra bajo intervención estatal desde abril de 2024. El informe de la Contraloría la señala como el caso más crítico:

Su deuda con la red de servicios pasó de COP$22 billones a casi COP$26 billones en un año.
Registra COP$17 billones en anticipos que aún no han podido ser justificados contablemente.
No entrega información financiera a la Superintendencia Nacional de Salud desde marzo de 2024 (febrero de 2024, según la resolución de la SuperSalud).
Sus estados financieros no están aprobados desde diciembre de 2023 y la entidad no ha podido cerrar contablemente los años 2024 y 2025, alegando que necesita procesar facturación pendiente en sus sistemas.

Para dimensionar la magnitud: según cifras que el interventor Jorge Iván Ospina presentó ante la Superintendencia, la Contraloría y el Ministerio de Salud, Nueva EPS cerró 2024 con pérdidas por COP$4,8 billones, patrimonio negativo de COP$11,9 billones y pasivos por COP$22,5 billones, frente a activos de COP$10,6 billones (cifras publicadas por El Colombiano).

El 18 de agosto de 2026, la Superintendencia Nacional de Salud designó mediante la Resolución 2026320030008580-6 a Roberto José Tercero Solano Navarra como nuevo agente especial interventor, en reemplazo de Ospina, con vigencia hasta el 10 de abril de 2027. Como contralora del proceso fue designada la firma Baker Tilly Colombia. La Supersalud reportó que el 51% de las reclamaciones de los usuarios se concentran en tres causas: negación de servicios previamente autorizados, complicaciones para asignar citas y demoras en la atención.

En paralelo, el presidente Gustavo Petro aseguró públicamente que «la mitad de la deuda de la Nueva EPS corresponde a la nación, es decir 11 billones de pesos que la nación debe pagar» y ordenó liquidar las EPS que estén en quiebra, aunque sin detallar el mecanismo, según reportó Pulzo.

Las EPS intervenidas tampoco levantan cabeza

El Gobierno mantiene nueve EPS bajo intervención estatal y otras dos con medidas especiales, según Pulzo. Sin embargo, los datos del primer trimestre de 2026 muestran que la intervención no está revirtiendo el descalabro:

Las EPS intervenidas gastaron COP$117,8 por cada COP$100 que recibieron.
Las EPS no intervenidas gastaron COP$100,8 por cada COP$100.

La Contraloría fue categórica: «Pese al tiempo transcurrido desde la adopción de las medidas especiales de intervención, ninguna de las EPS intervenidas ha logrado recuperar su patrimonio ni aproximarse a los parámetros mínimos establecidos». El documento fue elaborado antes de la salida de Carlos Hernán Rodríguez del organismo de control; actualmente la entidad está en cabeza de Jorge Eliécer Laverde.

Qué significa esto para tu startup

La crisis del sistema de salud colombiano no es solo un tema de política pública: abre oportunidades concretas para startups de healthtech, fintech y logística que sepan dónde apuntar.

Para founders de healthtech:

Gestión de cartera y conciliaciones — Nueva EPS reconoce que no puede cerrar contablemente 2024 y 2025 porque su facturación pendiente no ha podido ser procesada. Hay espacio para software de conciliaciones, automatización de cuentas médicas y procesamiento inteligente de facturas en salud, un mercado hoy capturado en buena parte por hojas de cálculo.
Cadena de suministro de medicamentos — la deuda con farmacéuticas creció 33% en un año (COP$2,85 billones → COP$3,8 billones). Soluciones de trazabilidad, financiación a proveedores o marketplaces B2B con líneas de crédito pueden atacar un cuello de botella concreto y verificable.
Atención al usuario — el 51% de las quejas se concentran en tres causas operativas (negación de servicios, citas, demoras). Hay un nicho claro para agendamiento inteligente, chatbots clínicos y herramientas de gestión de autorizaciones.

Acciones concretas que podés implementar esta semana:

Mapeá los cuellos de botella del lado público. Si tu startup toca pacientes o prestadores en Colombia, revisá cuánto de tu flujo de caja depende de EPS intervenidas: el indicador COP$117,8 gastados por cada COP$100 ingresados es una señal de que la morosidad va a empeorar antes de mejorar.
Explorá alianzas con ADRES y con la SuperSalud. El interventor de Nueva EPS tiene la obligación de presentar un diagnóstico y un plan de trabajo dentro del mes siguiente a su posesión (agosto de 2026). Es un momento de excepción donde el regulador está abierto a propuestas.
Modelá escenarios de liquidación. Petro ya ordenó liquidar las EPS en quiebra. Si tu producto asume afiliados de una EPS liquidadora, diseñá un plan de migración de usuarios y de datos clínicos desde ya.

El sistema colombiano de salud lleva años en terapia intensiva; las cifras de la Contraloría confirman que 2025 fue, en el mejor de los casos, un año perdido. Para founders, eso traduce tanto en riesgos de cobro como en oportunidades para construir la infraestructura que el sistema necesita y todavía no tiene.